生物信息大数据中心

Integrative Bioinformatics Center,
National Institute for Health Data

生物组学数据与工具

生物信息大数据中心开发的多种生物组学数据处理平台

MHCII-多肽数据集

人工整合超过6万条去冗余MHCII-多肽互作数据,作为此类预测方法的标注测试集

详情

蛋白组-代谢组疾病预测方法

在本研究中,我们开发了一个基于变分图自编码器(VGAE)的框架,用于预测跨十种生物的基因组规模异质性酶反应网络中的代谢途径相互作用(MPI).

详情

酶稳定性数据集

构建了最完整的酶活性和稳定性数据集,我们采用了最近开发的形式化方法,有效地识别了蛋白质结构中稳定性强弱的区域,并将其应用于一大组已知实验结构和催化位点的球形酶.

详情

抗原表位预测数据集和预测方法

我们从SAbDab数据库收集并整理了一个高质量的表位数据集。将SeRenDIP-CE构象表位预测器添加到了我们的Web服务器中,用户只需提供一个单一的抗原序列作为输入,该方法能够立即在广泛的生物医学和生物分子研究中应用。

详情

蛋白的稳定性预测工具

我们开发了SWOTein预测器,该预测器基于三种类型的统计能量函数来识别蛋白质中的强弱残基.

详情

溶解度预测工具

SOLart是一种新颖且高效的蛋白质溶解度预测方法。凭借其用户友好的界面,专家和非专家用户均可利用其预测结果,分析并改善参与生物技术过程中的目标蛋白溶解度特性.

详情

蛋白质互作位点预测工具

我们的预测器在同源和异源界面的预测上表现出色,优于其他方法。这表明,我们的预测器能够捕捉到同源二聚体和异源二聚体界面的共同特征。

详情

生成抗体评估平台

用于评估、设计和优化抗体的生成过程。该平台可以帮助研究人员从抗体的设计到最终的实验验证,预测抗体的特性并优化其效果。

详情

外泌体疾病组学平台

SVAtlas 是第一个收集和整理来自不同物种的单个外泌体(EV)数据的数据库。我们的目标是协同开发一个多组学的单个外泌体景观,促进科学家之间的高效互动,并遵循 MISEV(外泌体研究最小信息标准)规范。

详情

中心成员

联系我们

国家健康医疗大数据研究院生物信息大数据中心

地址

山东省济南市市中区山大兴隆山校区

联系我们

houqingzhen@sdu.edu.cn